Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms