Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXPE4Q6UWF7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms