Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms