Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPANXN4Q5MJ08 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms