Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms