Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms