Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms