Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms