Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRNQ16849 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRNQ16849 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PTPRNQ16849 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PTPRNQ16849 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PTPRNQ16849 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PTPRNQ16849 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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