Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPROQ16827 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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