Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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