Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms