Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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