Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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