Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms