Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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