Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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