Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms