Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRADDQ15628 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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