Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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