Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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UBE3CQ15386 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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UBE3CQ15386 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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