Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPRRQ15256 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPRRQ15256 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPRRQ15256 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PTPRRQ15256 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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