Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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