Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD11Q14690 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms