Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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