Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPSQ13938 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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