Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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TUBA3CQ13748 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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