Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms