Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAMK2BQ13554 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms