Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BFSP2Q13515 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms