Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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