Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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