Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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