Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms