Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
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