Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms