Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXD4Q12950 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXD4Q12950 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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