Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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