Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD3Q12873 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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