Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms