Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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