Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms