Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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