Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms