Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms