Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms