Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EN1Q05925 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EN1Q05925 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms