Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLCB3Q01970 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms