Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms