Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP4P57723 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms